Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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