Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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H2-Eb1P04230 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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H2-Eb1P04230 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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H2-Eb1P04230 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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H2-Eb1P04230 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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H2-Eb1P04230 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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H2-Eb1P04230 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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