Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms