Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
XntrpcF8VQM8 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms