Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rrn3B2RS91 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms