Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2al1jA2BFR3 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms