Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Scn3aA2ASI5 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Scn3aA2ASI5 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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