Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rnf17Q99MV7 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf17Q99MV7 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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