Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Dnajc28Q8VCE1 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms