Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hoxa13Q62424 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hoxa13Q62424 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms