Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sft2d1Q5SSN7 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms