Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SbdsP70122 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms