Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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