Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43790-201ENSMUST00000202694 2013 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC156273.1-201ENSMUST00000214570 2762 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Xntrpc-201ENSMUST00000084843 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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