Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Vpreb2P13373 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms