Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb1P13372 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms