Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
P10404 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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