Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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