Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Rnf4Q9QZS2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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Rnf4Q9QZS2 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rnf4Q9QZS2 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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