Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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