Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms