Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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