Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm37619-201ENSMUST00000193219 724 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm7397-201ENSMUST00000208298 361 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Pafah1b2-203ENSMUST00000214179 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC124778.2-201ENSMUST00000215837 453 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC123665.2-201ENSMUST00000226636 432 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Apoh-201ENSMUST00000000049 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm25704-201ENSMUST00000083116 168 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Zdhhc22-201ENSMUST00000095521 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gmfb-202ENSMUST00000111817 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gmfb-201ENSMUST00000079314 4171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm4640-201ENSMUST00000203927 2352 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Mcf2l-201ENSMUST00000095456 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rdh12-202ENSMUST00000122227 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Platr1-201ENSMUST00000188474 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Etfbkmt-203ENSMUST00000111548 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Slc30a6-201ENSMUST00000024870 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Prim1-205ENSMUST00000178041 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm38404-201ENSMUST00000202005 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Cga-202ENSMUST00000108130 609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Lyg1-202ENSMUST00000114894 798 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Timp1-202ENSMUST00000115342 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm12431-201ENSMUST00000120693 168 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm2568-201ENSMUST00000146126 1166 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Snhg12-206ENSMUST00000153474 606 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 4931429L15Rik-203ENSMUST00000172280 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Znf48Q3US17 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms