Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trafd1Q3UDK1 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms