Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm3745-201ENSMUST00000193773 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccbe1Q3MI99 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms