Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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