Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC164625.1-201ENSMUST00000214034 3036 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PdgfaP20033 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms