Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PolP10400 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PolP10400 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms