Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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