Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Drp2-204ENSMUST00000113228 3141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Asns-201ENSMUST00000031766 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Acvr1-204ENSMUST00000112601 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr237-ps1-202ENSMUST00000215911 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Grm8-201ENSMUST00000090512 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hdac5Q9Z2V6 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms