Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Atg3Q9CPX6 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms