Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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