Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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