Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp49Q6P9L4 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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