Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Spire1Q52KF3 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spire1Q52KF3 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms