Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sec31aQ3UPL0 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms