Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ctdnep1Q3TP92 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms