Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Cul4aQ3TCH7 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms