Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SbdsP70122 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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