Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms