Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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