Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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RxraP28700 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RxraP28700 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
RxraP28700 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
RxraP28700 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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