Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms