Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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H2-Eb1P04230 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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H2-Eb1P04230 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms