Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P01649 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P01649 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms