Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Egf-209ENSMUST00000199615 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 CT009530.1-201ENSMUST00000227348 2927 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Gm2056J3QQ02 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm2056J3QQ02 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms