Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cldn34c3J3QJW5 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms