Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Spocd1B1ASB6 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Spocd1B1ASB6 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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