Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.1 ms