Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc97Q9DBT3 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms